Özel Çekmeköy Bahçeşehir Koleji Ortaokulu İstanbul'un Çekmeköy semtinde hizmet verir. Teknoloji destekli tam donanımlı sınıflarda eğitim veren okulda maksimum sınıf mevcudu 24'tür. Yemekhanede günde 3 öğün yemek servis edilir. Öğrencilerin sağlığına uygun şekilde, uzman şefler tarafından yerinde hazırlanan bu yemekler, yine alanında uzman diyetisyenler tarafından oluşturulan listelere uygun hazırlanır. Öğrencilerin sağlığını her şeyin üstünde tutan Özel Çekmeköy Bahçeşehir Koleji Ortaokulu'nda haftanın 6 günü hizmet veren bir revir ve bir hemşire bulunmaktadır. Liseye hazırlık aşaması olan ortaokul eğitimini en iyi şekilde sağlayan okulda, STAM+A Merkezlerinde kütüphane, fen laboratuvarı, kütüphane, sanat atölyesi, bilgisayar laboratuvarı gibi farklı alanlar birleştirilerek, disiplinlerarası çalışmalarda mümkün olan en üst seviyede imkanlar sağlanır. Özel Çekmeköy Bahçeşehir Koleji Ortaokulu'nda her öğrencinin özel olduğunu bilen psikolojik danışmanlar, öğrencilerin bireysel ilgi alanlarına ve yeteneklerine göre onları yönlendirerek, lise hayatlarına daha bilinçli hazırlanmalarına yardımcı olur. Çift Dilli Eğitim uygulaması kapsamında temel disiplin dersleri İngilizce ve Türkçe verilerek kavramların daha iyi anlaşılmasına, öğrencilerin İngilizceyi ezber dışında, anlamlandırarak öğrenmesini sağlar. İngilizceyi olması gereken aksanla öğrenen öğrenciler, dünya vatandaşı olma yolunda gereken edinimleri de kazanarak kariyer yoluna bir adım önce başlar. 21. yüzyılın bir gereği olan dijitalleşme Robotik ve Kodlama eğitimi ile Bahçeşehir Okulları'nda yerini bulur. Öğrencinin çağın gerektirdiği becerileri edinmesi sağlanarak, bilinçli bir teknoloji tüketicisi olmanın ötesinde, teknoloji üreticisi olmaları amaçlanır. Özel Çekmeköy Bahçeşehir Koleji Ortaokulu'nda verilen donanımlı akademik eğitimin yanında, öğrencileri sosyal hayata hazırlamak, empati sahibi, duyarlılığı gelişmiş bireyler yetiştirmek amacı ile Değerler Eğitimi dersi verilir.